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尊龙凯时细菌基因组DNA提取实验准备

发布时间:2025-03-01   信息来源:尊龙凯时官方编辑

在细菌基因组DNA提取实验中,我们通过细菌培养和收集,获得了充足的样本量。接下来的关键步骤是细胞裂解,主要目的是破坏细菌的细胞壁和细胞膜,从而释放出DNA。我们采用化学与物理法相结合的方式,先使用特定酶类处理样本,这些酶可以特异性降解细菌细胞壁成分,继而通过超声波或法式压碎法进一步破碎细胞,确保DNA充分释放。

尊龙凯时细菌基因组DNA提取实验准备

细胞裂解后,如何有效分离和纯化DNA是我们面临的挑战。通过利用DNA在不同盐浓度和pH值下的溶解度差异,我们可以进行一系列有机溶剂抽提步骤,去除蛋白质、多糖等杂质,同时保护DNA不受降解。每个操作步骤都必须谨慎进行,避免剧烈振荡,以防DNA断裂。

实验步骤

一、试剂盒组成与保存

1. 说明书及耗材:DNA制备管、小量滤器、2ml离心管、15ml离心管。
2. RNaseA:50mg/ml,室温保存。
3. *:50%甘油溶解*,使*浓度为50mg/ml,-20℃密闭储存。
4. Buffer S:细菌原生质制备液,加入RNaseA后,4℃密闭储存。
5. 0.25M EDTA:室温密闭储存。
6. Buffer G-A:裂解液,室温密闭储存。
7. Buffer G-B:蛋白去除液,室温密闭储存。
8. Buffer DV-A:请依照实验准备方法制备,室温密闭保存。
9. Buffer DV:相分离液,室温密闭保存。
10. Buffer BV:DNA结合液,室温密闭储存。
11. Buffer W1:洗涤液,室温密闭储存。
12. Buffer W2浓缩液:使用前加入无水乙醇并混合均匀,室温密闭储存。可用100%或95%乙醇。
13. Eluent:25mM Tris-HCl,pH 8.5,室温密闭保存。

二、实验准备

1. 每次使用前,在Buffer W2中按照试剂瓶上的量加入无水乙醇并混合均匀。
2. 准备Buffer DV:取2ml Buffer DV-A,125ml异丙醇,75ml,混合均匀。
3. Buffer DV在4℃预冷。
4. 每次使用时,将50%甘油溶解*,使浓度为50mg/ml。
5. 使用时,将RNaseA加入Buffer S中,均匀混合。
6. 准备65℃水浴。
7. 检查Buffer G-A和Buffer G-B若出现沉淀,使用65℃水浴加热使沉淀溶解。
8. 将Eluent或去离子水加热至65℃以帮助充分洗脱基因组DNA。

三、操作步骤

1. 收集10×10^9(1ml菌液OD600为1-1.5)的细菌培养,在2ml离心管中以12000×g离心30秒并弃去上清。用150μl已加入RNaseA的Buffer S悬浮沉淀,确保RNaseA已加入Buffer S中,悬浮需均匀。
2. 加入20μl*贮存液,室温静置5分钟。
3. 添加30μl 0.25M EDTA(pH 8.0),混合均匀并进行冰浴5分钟。
4. 加入450μl Buffer G-A,旋涡振荡15秒,65℃水浴10分钟。
5. 添加400μl Buffer G-B和1ml冷却的Buffer DV,进行强烈混合后以12000×g离心2分钟。
6. 尽量丢弃上相,保留相间沉淀和下相,加入1ml冷却的Buffer DV,强烈混合并再次以12000×g离心2分钟。
7. 丢弃上相,将下相转移至滤器并进行离心,以12000×g离心1分钟,确保上相不被弃尽。
8. 在滤液中加入400μl Buffer BV,混合均匀。
9. 可以选择负压法或离心法进行后续操作。

在最后一步中,通过乙醇沉淀法,我们将提纯的DNA从溶液中析出。此过程需要在低温下进行,以促进DNA的凝聚及沉淀。沉淀物经过离心收集后,用70%乙醇洗涤,以去除残留的盐分和有机溶剂,这是确保DNA纯度的关键步骤。

最后,将洗涤后的DNA沉淀晾干,并溶解于适量的TE缓冲液中,得到高纯度的细菌基因组DNA溶液。通过电泳检测,我们可以直观观察到DNA条带的清晰度和完整性,从而评估提取效果,整个实验圆满结束,为后续的分子生物学研究打下坚实基础。

尊龙凯时致力于提供优质的生物医疗实验材料和先进的提取技术,让每一位科研工作者都能更加高效地进行实验。